Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm379J3QQ19 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm379J3QQ19 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm379J3QQ19 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm379J3QQ19 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm379J3QQ19 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm379J3QQ19 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm379J3QQ19 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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