Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm2056J3QQ02 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms