Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20877J3QPZ4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms