Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm11236J3QMS7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11236J3QMS7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms