Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn20G5E8X0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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