Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms