Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syde2E9PUP1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms