Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syce3B5KM66 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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