Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrt4B2RU40 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms