Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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