Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbp4A4UUI3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms