Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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AgrnA2ASQ1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AgrnA2ASQ1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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