Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syndig1A2ANU3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syndig1A2ANU3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms