Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc183A2AJB1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc183A2AJB1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms