Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vstm4T1NXB5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vstm4T1NXB5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vstm4T1NXB5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vstm4T1NXB5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms