Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26938S4R185 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm26938S4R185 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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