Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Robo3Q9Z2I4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Robo3Q9Z2I4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Robo3Q9Z2I4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms