Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Letm1Q9Z2I0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Letm1Q9Z2I0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Letm1Q9Z2I0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Letm1Q9Z2I0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Letm1Q9Z2I0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Letm1Q9Z2I0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Letm1Q9Z2I0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms