Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mbd1Q9Z2E2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd1Q9Z2E2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms