Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ilf3Q9Z1X4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms