Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ap3b1Q9Z1T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Ap3b1Q9Z1T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms