Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arid3bQ9Z1N7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid3bQ9Z1N7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms