Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp4Q9Z1N6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp4Q9Z1N6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms