Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne6Q9Z140 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms