Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip2Q9Z0H8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip2Q9Z0H8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms