Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme4Q9WV84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme4Q9WV84 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme4Q9WV84 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme4Q9WV84 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme4Q9WV84 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms