Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ArcQ9WV31 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms