Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni1Q9WUZ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni1Q9WUZ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms