Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cul1Q9WTX6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul1Q9WTX6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul1Q9WTX6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms