Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TfebQ9R210 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TfebQ9R210 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms