Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb2Q9R1P3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms