Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb3Q9R1P1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms