Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubd1Q9R1K7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tubd1Q9R1K7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubd1Q9R1K7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms