Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rfwd2Q9R1A8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfwd2Q9R1A8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms