Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ntn3Q9R1A3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntn3Q9R1A3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntn3Q9R1A3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntn3Q9R1A3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ntn3Q9R1A3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms