Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod1Q9R0E2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plod1Q9R0E2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plod1Q9R0E2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plod1Q9R0E2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plod1Q9R0E2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plod1Q9R0E2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Plod1Q9R0E2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms