Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek3Q9R0A5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek3Q9R0A5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek3Q9R0A5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek3Q9R0A5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms