Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn2Q9R0A1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn2Q9R0A1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clcn2Q9R0A1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn2Q9R0A1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn2Q9R0A1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms