Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf4Q9QZS2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms