Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ercc4Q9QZD4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc4Q9QZD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc4Q9QZD4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms