Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a3Q9QZB6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr4a3Q9QZB6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a3Q9QZB6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a3Q9QZB6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a3Q9QZB6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a3Q9QZB6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms