Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt3Q9QZ47 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt3Q9QZ47 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms