Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rdh11Q9QYF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rdh11Q9QYF1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Rdh11Q9QYF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rdh11Q9QYF1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rdh11Q9QYF1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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Rdh11Q9QYF1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rdh11Q9QYF1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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