Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp1Q9QY53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp1Q9QY53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp1Q9QY53 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms