Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf3Q9QXK7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms