Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Limd1Q9QXD8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Limd1Q9QXD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms