Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim44Q9QXA7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim44Q9QXA7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim44Q9QXA7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms