Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcea2Q9QVN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcea2Q9QVN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcea2Q9QVN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms