Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csnk1eQ9JMK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csnk1eQ9JMK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk1eQ9JMK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csnk1eQ9JMK2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms