Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nectin3Q9JLB9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nectin3Q9JLB9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nectin3Q9JLB9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nectin3Q9JLB9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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